Ponieważ w chwili obecnej nie są znane ani przyczyny powstawania, ani również mechanizmy sprzyjające rozwojowi dysplazji, nie można zaproponować jednego skutecznego sposobu leczenia dysplazji.

U pacjentów z FMD mogą wystąpić zdarzenia zakrzepowe i zakrzepowo-zatorowe, nawet przy braku rozwarstwienia lub tętniaka, dlatego leki przeciwpłytkowe są uzasadnione zarówno w przypadku objawowej, jak i bezobjawowej FMD.

Nadciśnienie tętnicze często występuje u pacjentów z FMD, i jest to spowodowane albo nadciśnieniem samoistnym, albo z powodu nadciśnienia naczyniowo-nerkowego związanego z zajęciem tętnicy nerkowej. Kontrola nadciśnienia tętniczego jest szczególnie ważna u pacjentów z FMD, u których występują tętniaki wewnątrzczaszkowe, a także tętniaki w innych lokalizacjach. Niektóre leki przeciwnadciśnieniowe mogą być również skuteczne jako terapie zapobiegawcze migreny.

Połowa pacjentów zgłasza bóle głowy co najmniej raz w tygodniu. Chociaż migreny są najczęstszym typem bólu głowy wśród pacjentów z FMD, ból głowy może być również związany z niekontrolowanym nadciśnieniem tętniczym. Migreny mogą wystąpić u pacjentów z FMD nawet przy braku zajęcia naczyń mózgowych. Podobnie jak w przypadku wszystkich pacjentów z migreną, podejście do leczenia migreny u pacjentów z FMD może obejmować modyfikację stylu życia w celu uniknięcia czynników wyzwalających, terapie zapobiegawcze i leki zapobiegające migrenom. Pulsujący szum w uszach został niedawno uznany za częstą manifestację FMD naczyniowo-mózgowej. Terapia może być pomocna u niektórych pacjentów z cięższymi objawami, chociaż doświadczenie w leczeniu pulsującego (w porównaniu z niepulsującym) szumu w uszach jest ograniczone. Konsultacje z audiologiem i otolaryngologiem mogą być pomocne w ocenie słuchu i ocenie innych przyczyn pulsującego szumu w uszach poza FMD. 

Wykazano, że zaprzestanie palenia tytoniu przynosi wiele korzyści zdrowotnych w populacji ogólnej. U pacjentów z FMD, którzy palą, częściej występują tętniaki i występuje więcej zdarzeń niepożądanych, w tym konieczność zabiegów naczyniowych. Należy zdecydowanie zachęcać wszystkich pacjentów z FMD, którzy nadal palą do zaprzestania palenia.